Органичен въглерод, която формира биологичните помпата се транспортира от потъване частици материал, например мъртви организми, (включително водорасли Матс) или фекални гранули. Обаче някои въглерод достига, океана като разтворен органичен въглерод (DOC) от пренос на физически процеси като downwelling, вместо да потъване. Въглероден помпа.