Τα δύο σκέλη που συνθέτουν DNA κατέχονται από κοινού από συγκεκριμένα υδρογόνου συγκόλληση μεταξύ πουρίνες και pyrimidines (A ζεύγη με T- και G ζεύγη με C). Το μέγεθος ενός νουκλεϊκού οξέος μόριο συχνά περιγράφεται όσον αφορά τον αριθμό των ζευγών βάσης (σύμβολο: bp) ή χιλιάδες ζεύγη βάσης (κιλοβάσεων ζευγών, σύμβολο: kb, μια πιο βολική μονάδα) που περιέχει.