Την γραμμική συστοιχία γονιδίων σε ένα χρωμόσωμα, βασίζονται σε ανασυνδυασμού συχνότητες (διασύνδεση χάρτη) ή φυσική θέση (φυσική ή χρωμοσωμική χάρτη).