EBM integra conocimientos de interrelaciones ecológicas para administrar los impactos en un ecosistema. Aplicación efectiva del EBM debe: (1) considerar los procesos ecológicos que operan tanto dentro y fuera de los límites del ecosistema, (2) reconocen la importancia de la diversidad de especies y hábitats y (3) acomodar usos humanos y beneficios asociados dentro del contexto de los requisitos de conservación.