Keemiliselt, ühend või molekul sisaldab süsiniku seotud vesiniku. Orgaanilised ühendid moodustavad kogu elusaine. Orgaanilised mõistet kasutatakse sageli eristama keemilistest "sünteetiline" need "looduslik" tooteid või protsesse. Seega looduslik väetis sisaldab sõnnik või fosforiidihiib sünteesitud keemiliste lähteainete väetiste asemel. Samuti mahepõllumajanduse kahjurite juhitakse viljelustehnika ja saadud looduslikest allikatest (nt taimejuurte mahlad ja püretriinid, mõlemad taimed) pestitsiidide kasutamine ning looduslikud väetised (nt sõnnik ja kompost) kasutamine. Mõned tarbijad, väites, et sünteetilised Kemikaalidest tuleneva ohu eelistate orgaanilisi toiduaineid. The ASJAOLU seaduse 1990 nõutav USDA orgaaniline toit turustamise eesmärgil määratleda ja rakendada riiklikud mahepõllumajandusliku programm.