Variasi antara individu dalam ukuran fragmen DNA yang dipotong oleh enzim pembatasan khusus; urutan polimorfik yang mengakibatkan RFLPs digunakan sebagai penanda pada peta fisik dan genetik linkage maps. RFLPs biasanya disebabkan oleh mutasi pada situs pemotongan.

Lihat juga: marker, Polimorfisme.