מולקולת ה-DNA גדילי כפול או DNA-RNA היברידית, איפה גדיל אחד של מקור שונים, ואחד כתוצאה מכך המכיל או יותר תואמים בסיסים (שאינם משלימים). דופלקס דנ א מוכן על ידי הכלאה של מולקולות דנ א חד גדילי נגזר משני מקורות שונים. איפה DNAs שני זהה או דומה מאוד רצפים, מולקולה כפול גדילי יוקם, ואילו איפה שני DNAs שונים ברצף, יישאר אזורים חד-גדילי. Heteroduplex יתגלה בתור יחיד-strand "שיחי" כאשר ה-DNA הוא ציין אלקטרונים ברמה המיקרוסקופית. ובכך עשוי להיות נבנה מפת אזורים הומולוגיים, שאינם הומולוגיים של שתי מולקולות. תהליך זה ידוע בשם heteroduplex מיפוי.