Reaksjonen forhold - spesielt temperatur, salt concentration(s) og pH - dikterer annealing av enkelt-strandet DNA/DNA, DNA/RNA og RNA/RNA hybrider. På høy stringens, duplexes danne bare mellom tråder med perfekt direktemarkedsføringskampanjer komplementaritet; lavere stringens lar annealing mellom tråder med en viss grad av samsvar mellom baser.