Процедуры для определения нуклеотидной последовательности ДНК фрагмента. Существует два распространенных метода для этого:

• Максам и Гилберт техника (химическая деградация), которая использует различных химических веществ сломать ДНК в фрагменты в определенных базах; или

• Сэнгер техника (называемый в цепи завершением метод или ди deoxy) использует ДНК-полимеразы сделать новые цепочки ДНК, с ди deoxy нуклеотидов (цепь терминаторов), чтобы остановить цепь случайным образом, как он растет.

В обоих случаях фрагменты ДНК по длине разделяются электрофореза геля полиакриламида, позволяя последовательность для чтения непосредственно из геля.