1) Гаплотип — это набор вариаций ДНК или полиморфизмов, которые наследуются вместе. Термин "гаплотип" может относиться как к комбинации аллелей, так и к совокупности однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) в одной хромосоме. Информация о гаплотипах собирается международным проектом HapMap (занимающимся составлением карт гаплотипов) и используется для изучения влияния генов на заболевания.

2) Группа аллелей различных генов (как, например, главный комплекс гистосовместимости) на одной хромосоме, которые связаны достаточно плотно, чтобы наследоваться совокупно, как одно целое.