Výmenu prvkov medzi organickými a anorganickými štáty v pôde alebo inom substráte pôsobením živých organizmov. Vyplýva z biologického rozkladu organických zlúčenín s oslobodenie anorganických látok (mineralizácia) a využívania anorganických materiálov s syntézy mikrobiálnych tkaniva (imobilizáciu).