1.的一對核苷酸基地該表單氫鍵彼此。腺嘌呤 (A) 對與胸腺嘧啶 (T) (或與尿嘧啶 (U) 在 RNA） 及鳥嘌呤 (G) 對與胞嘧啶 (C)。

2.一對線段或將的核酸股之一的 hydridize (由氫鍵連接) 彼此。