1） 一个理论的代表核苷酸或者氨基酸序列中的每个核苷酸或者氨基酸是一个最常出现在该站点中的不同的序列在自然发生的。一词也是指实际的序列的近似理论的共识。A 已知设置的保守的序列由共识序列表示。通常，观察到 supersecondary 蛋白质结构 （氨基酸图案） 时，往往由保守序列。

2) A 序列模式从多个序列的代表的核苷酸或氨基酸最有可能发生在一个序列中的每个位置的对齐方式。